Uniwersum Gwiezdnych Wojen to jeden z najpopularniejszych filmowych światów. Widzowie z całego świata od razu rozpoznają charakterystyczne statki kosmiczne, planety, miecze świetlne i kostiumy. Pokazanie tego uniwersum w filmie animowanym, w taki sposób by było spójne z wizją stworzoną przez George'a Lucasa ponad 30 lat, temu stanowiło nie lada wyzwanie.

Akcja Wojen Klonów rozpoczyna się niedługo przed tym jak Anakin przejdzie na Ciemną Stronę Mocy i stanie się złowrogim Lordem Vaderem. W związku z tym Lucas i Filoni zdecydowali, że animowany film będzie opowieścią o jego bohaterstwie i przygodach, a nie ponurym przeznaczeniu, tak dobrze znanym wszystkim fanom gwiezdnej sagi. Inspiracji dostarczył twórcom realizowany w latach 2003-2005 na potrzeby kanału Cartoon Network animowany serial opowiadający o wojnach klonów.

W sukurs twórcom przyszła technologia. Dzięki komputerowej animacji w Wojnach Klonów udało się wykreować wyjątkowy, trójwymiarowy świat, a opowieść o przygodach Anakina Skywalkera opowiedzieć przy wykorzystaniu niecodziennych ujęć, oryginalnego oświetlenia oraz kadrowania.